Центр является одним из учредителей Сибирской ассоциации преподавания японского языка, объединяющей вузы, школы и другие учебные заведения Сибири (Новосибирск, Томск, Красноярск), в которых преподается японский язык. В МКЦ «Сибирь-Хоккайдо» располагается секретариат Ассоциации, проходят заседания и многие мероприятия проводимые совместно с МКЦ «Сибирь-Хоккайдо». Среди них: Новосибирский конкурс по японскому языку среди студентов и школьников, с 2006 года Сибирский региональный конкурс по японскому языку, семинары по методике преподавания японского языка и многое другое.
